Le CNRFP de par ses attributions est un centre d’excellence pour la recherche et la formation sur le paludisme au niveau national. Il dispose de ce fait d’une unité de diagnostic parasitologique fonctionnelle qui offre aux populations le diagnostic microscopique du paludisme avant tout traitement médicamenteux antipaludique. Il offre aussi un cadre opérationnel de formation pour les étudiants et de recyclage pour les professionnels de santé du public comme du privé en matière de diagnostic du paludisme et partant dans le domaine du paludisme de façon globale.
Chaque année le CNRFP accueille et encadre dans ses laboratoires, des étudiants de licence, de maîtrise et de thèse de Doctorat en médecine, pharmacie, biologie et sciences sociales, des agents de santé et des chercheurs nationaux et internationaux. Depuis 2011 on peut compter plus d’une centaine de stagiaires reçu au CNRFP soit au niveau central, soit sur les sites pour mener leur activité de recherche ou de perfectionnement en vue de l’obtention d’un diplôme ou d’une attestation.